从权威市场调查机构调查的结果来看，中小企业ERP软件应用相对简单，大部分只是应用了整个系统的一小部分，大多数经营产品的企业，只是建立了财务管理及生产计划、定单管理和库存管理控制系统，很少有企业实现了整个过程的信息管理。从权威市场调查机构调查的结果以及我市的调查情况看，施行中小企业ERP过程存在的下述问题：
    （1）企业IT环境差、企业专业ERP人才缺乏。企业缺乏精通IT的人才。目前中小企业ERP应用面临的主要问题是，如何培养造就一批既有理论基础，又有实践经验的专业人才，以满足企业不断增长的信息化建设需要，缺乏人才是ERP实施中的瓶颈。企业对计算机网络、系统软件、应用软件缺乏应用基础。     （2）对中小企业ERP的认识存在误区。认为ERP是一个“交钥匙工程”，对ERP实施顾问的工作过程和特点不了解，把实施顾问叫做“ERP施工队”；认为施行ERP是ERP服务商的事，企业施行ERP完全依赖服务商，这可能导致项目久拖不决。
    （3）企业管理水平、观念落后。对我市企业而言，管理模式相对落后，仍处于传统手工经验管理状态，企业在管理过程中，有些规章制度建设滞后，管理中还存在随意性、主观性和不规范性；粗线条的企业管理，制度不健全，而且一些规章制度执行不到位。这些都制约了ERP系统在企业的成功施行。中小企业ERP不仅是一种先进的管理工具，还融合了先进管理思想，如果企业自身的管理缺乏一定的基础，即使上了ERP，也发挥不了多大作用。
    （4）对实施困难、风险估计不足。中小企业ERP系统的施行对于企业来讲是一次管理上的改革、是一个系统工程，涉及到企业的方方面面。在ERP施行过程中，存在诸如：实施周期长、投资大、系统复杂性和不确定性等风险因素，使企业决策层必须对施行ERP系统的风险有足够的认识，提高化解风险的能力，否则，有ERP系统施行失败的可能。